國內高等教育環境快速變遷，如何面對全球性競爭的挑戰，讓理學院持續學術卓越，同時符合學生學習與就業之需求，是目前最重要的課題。

理學院規劃未來三項重要方針並擬定具體實行策略如下：

一、跨領域整合與學習：

理學院各系所在其專業領域之研究均有優異表現，同時配合課程或學程規劃，加強學生專業知能；為因應全球化的競爭及專業外國團隊優勢，跨領域整合相形重要，具體策略包括：

1. 結合不同領域的研究人員，例：醫學結合奈米科技與分析化學、數學結合生物科學等。藉由不斷的溝通與腦力激盪，建立新的整合領域研究。
2. 配合研究之跨領域整合，建立新的學程，吸引優秀學生就讀，也讓研究人員藉由學程之教授，達到教學相長之效果。
3. 定期舉辦學術研討會，邀請有整合研究成功經驗之主持人，共享其經驗，同時建立交流之平台。

二、加強產學合作：

理學院過去以基礎研究為主，許多優異研究成果都以藏諸名山為最後命運，若這些成果能應用到產業界，對國家經濟與人民福祉將有極大之助益。未來將以三項策略加強產業合作：

1. 邀請廠商與本院教師交流或共同研討會，建立合作平台。
2. 配合學術研究活動，增加教師與廠商合作機會。
3. 安排業界參訪，讓教師實際參觀公司，瞭解業界需求。
4. 設立產學相關學程或於各系所設立相關應用性課程，邀請業界先進擔任講員，以符合學生之就業需求。

三、推動國際化：

國際合作常因時空距離，難收實質具體之成果。然而國際合作可增加本院之能見度，共同發表之論文可增加引用次數，亦可擴大學生視野；具體策略包括：

1. 各系所擬1~2個優先合作或目前已有合作之國際學術機構，加強交流。
2. 鼓勵雙方共提國科會國際合作計畫。
3. 安排教師與研究生互訪及共同指導研究生，以利實質合作之進行。